خاک محیط رشد ونمو ریشه گوجه فرنگی می باشد و از این محیط گوجه فرنگی آب و عناصر غذایی مورد نیاز خود را جذی می کند.
خاک و کود دهی : گوجه فرنگی در انواع خاکها رشد می کند اما خاک خوب برای گوجه فرنگی باید زهکش خوبی داشته باشد. در خاک های شنی گوجه فرنگی زود می رسد اما برای تولید اقتصادی و پر محصول خاک های سیلت یا رسی لوم بسیار بارور را در نظر می گیرند.
PH مطلوب خاک برای گوجه فرنگی 5/6-6 می باشد. گوجه فرنگی بواسطه رشد سریع وطول دوره رویش طولانی نیاز آن به مواد غذایی زیاد است. برای تولید یک تن میوه ، گوجه فرنگی 5/1 تا 5/3 کیلوگرم ازت ، 2/0 تا 5/1 کیلوگرم فسفر ( 502P ) و 3/2 تا 5/5 کیلوگرم پتاسیم ( O2K ) از خاک خارج می سازد.
با آبیاری قطره ای می توان نیتروژن مورد نیاز گیاه را به طور هفته ای محاسبه نمود و همراه آب آبیاری در اختیار گیاه قرار داد.در ذیل بسته به نوع گیاه ،مرحله رشد و میزان تولید محصول مقدار مصرف کود نیتروژن در هر هفته تعیین شده است.محاسبه کود نیتروژن مورد نیاز گیاه را می توان بااستفاده آزمون خاک و برگ دقیق تر انجام داد.
گوجه فرنگی به میزان کافی به عناصر غذایی برای تولید میوه نیاز دارد. به ویژه کلسیم , پتاسیم و ازت عناصر غذایی مهمی هستند . عدم تامین این عناصر غذایی به مقدار کافی موجب ضعیف شدن بوته ها و کاهش کیفیت میوه گوجه فرتگی می شوند. گوجه فرنگی به فسفر برای تولید گل و میوه و ریشه زایی نیاز دارد. مصرف بیش از اندازه فسفر موجب تولید گل به تعداد خیلی زیاد می شود که بوته گوجه فرنگی اگر به اندازه کافی شاخه و برگ نداشته باشد گل های تولید شده دچار ریزش می شوند.گوجه فرنگی برای تولید شاخه و برگ به عنصر ازت نیاز دارد.
هر زمان مقدار کلسیم میوه کمتر از 2/0 در صد باشد , به طور کلی پوسیدگی گلگاه بوجود می آید. همچنین , وقوع پوسیدگی گلکاه هنگامی افزایش می یابد که کود های دارای ازت , منیزیوم , پتاسیم , کلر زیاد و کلسیم پائین استفاده گردد.افزودن کود کلسیم دار و محلول پاشی آنها روی گوجه فرنگی در مزرعه و گلخانه به مقدار زیاد موجب کاهش شیوع پوسیدگی گلگاه می گردد. جذب کلسیم از خاک همبستگی زیادی با تشعشع خورشیدی و دمای سیستم ریشه دارد. حرکت کلسیم در داخل گیاه و تجمع آن در بافت ذخیره و میوه , به حرکت تعرقی آب مربوط می شود. کلسیم فقط در آوند چوبی حرکت می کند , که این یک حرکت یک طرفه از ریشه ها به اندام هوایی می باشد.